Ein Raum im Museum zeigt einige Beispiele lokaler sakraler Kunst aus dem Nachlass des Brunecker Chronisten Johann Nepomuk Tinkhauser sowie Leihgaben und Schenkungen, wie der „Gewölbeschlussstein mit Engelsbüste“ (um 1459) von Michael Pacher, ein Tafelbild von seinem Mitarbeiter Friedrich Pacher als auch Werke von dessen Schüler Simon von Taisten und zwei Tafelbilder des Meisters von Uttenheim, vermutlich aus der Pfarrkirche von Uttenheim. Der spätgotische„Sonnenburger-Altar“ (1490) von Simon und Veit von Taisten ist ein zentrales Werk der Dauerausstellung.